Будучи Международным коммерческим аэропортом, аэропорт Мальты полностью соответствует стандартам ИКАО.  Аэропорт имеет две взлетно-посадочные полосы. Основная взлетно-посадочная полоса 13/31 главным образом используется для коммерческих перевозок, её длинна составляет 3544 метра, она оснащена ILS/ DME, навигационной системой VOR/ NDBс PAPIогнями.

Вторая взлетно-посадочная полоса 05/23, как правило, используется для авиации общего назначения, её длинна составляет 2377 м., она также оснащена VOR / NDB и PAPI огнями. На аэродроме имеется автоматическая система погодного обеспечения  ATIS и VOLMET.